Funkcję Sekretariatu KST dla Wszystkich Krajowych Sieci Tematycznych pełni Krajowa Struktura Wsparcia PIW EQUAL. Do zadań Sekretariatu KST należy organizacja oraz zarządzanie pracami Sieci Tematycznych na poziomie krajowym. Za koordynację całości prac Sekretariatu KST odpowiada Koordynator. W celu usprawnienia funkcjonowania Sekretariatu KSW powołuje także Sekretarza KST dla każdej Sieci Tematycznej. Do głównych zadań Sekretariatu KST należy:
- zawiadamianie IZ o miejscu i terminie posiedzeń,
- zawiadamianie członków KST o miejscu i terminie posiedzeń,
- zapewnienie tłumaczenia niezbędnych materiałów i dokumentów na potrzeby KST,
- uczestniczenie w posiedzeniach KST,
- zlecanie wykonania dodatkowych analiz, ekspertyz niezbędnych do realizacji zadań KST,
- wykonywanie innych zadań, wynikających z bieżących prac KST, zleconych przez KST lub Przewodniczącego KST.
- ustalanie zakresu informacji zamieszczanych na stronie internetowej KSW, w części dotyczącej KST,
- prowadzenie forum internetowego KST,;
- planowanie i gromadzenie materiałów do kwartalnego biuletynu informacyjnego EQUAL.
zapewnienie przepływu informacji pomiędzy KST, KST i KSW oraz IZ EQUAL;
- udział w spotkaniach Grupy Strategicznej,
- wspieranie IZ EQUAL w przygotowaniu materiałów na potrzeby Grupy Strategicznej EQUAL oraz w opracowywaniu wytycznych na podstawie zidentyfikowanych przez Grupę Strategiczną potrzeb innowacyjnych rozwiązań w zakresie polityki zatrudnienia i integracji społecznej.
- sporządzanie protokołów z posiedzeń KST,
- przygotowywanie informacji z działania KST uwzględnianych w sprawozdaniach okresowych i końcowych z realizacji Tematu,
- gromadzenie i przechowywanie dokumentacji związanej z pracami KST, w szczególności protokołów z posiedzeń oraz dokumentacji związanej z walidacją rezultatów.